- обратиться с предложениями к Президенту Азербайджанской Республики, в Кабинет Министров Азербайджанской Республики в связи с отношениями государство- религия, усовершенствованием законодательства о религии;

- контролировать производство литературы, предметов религиозного назначения, других информационных материалов религиозного содержания, их импорт и распространение, давать согласие в предусмотренном законодательстве порядке согласно обращениям религиозных структур и соответствующих государственных органов;

- разрабатывать вопросы, отнесенные к полномочиям и в установленном законодательством порядке привлекать экспертов и консультантов для их выполнения, заключать с ними договора (контракты);

- учреждать в установленном законодательством порядке органы периодической печати, выпускать специальные бюллетени и другие издания;

- учреждать соответствующие структуры в рамках полномочий и с целью осуществления задач, стоящих перед Комитетом;

- получать информацию о деятельности существующих в республике религиозных учебных заведений, проводить с этих учреждениях проверок с привлечением экспертов, в случае наличия в их деятельности действий, противоречащих существующему законодательству, поднимать вопрос об этом перед религиозными центрами или соответствующими государственными органами.

- регулярно информировать Президента Азербайджанской Республики и Кабинет Министров о действиях и обстоятельствах, связанных с религиозным расколом, конфессиональной дискриминацией, религиозно-политическими провокациями против национальной безопасности и другой незаконной религиозной деятельностью, поднимать об этом вопрос перед соответствующими государственными органами;

- поднимать перед центрами и управлениями, где представлены религиозные структуры, а также отдельные лица, вопрос о противоречащих законодательству действиях в связи со свободой их вероисповедания;

- в установленном порядке обратиться в суд о прекращении деятельности религиозных структур в случае нарушения положений законодательства Азербайджанской Республики в связи со свободой вероисповедания;

- в случае необходимости вмешиваться в деятельность религиозных структур в предусмотренных законом формах с целью обеспечения соблюдения требований законодательных актов, связанных со свободой вероисповедания Азербайджанской Республики;

- осуществлять регистрацию религиозных структур, ставить перед соответствующими государственными органами вопрос с целью оказания помощи регулированию в соответствии с законодательством деятельности незаконно функционирующих религиозных структур, а также созданных отдельными лицами мест поклонения, не имеющих исторических традиций и корней;

- принимать участие в разработке в государственных образовательных заведениях учебных программ, учебных пособий по предметам религиоведение, истории религии, религиозно-познавательным, религиозно-философским дисциплинам и основам священных книг;

- поднимать вопрос перед соответствующими организациями в соответствующем закону порядке о возвращении религиозным общинам ранее конфискованные и используемые для других целей религиозных объектов;

- держать под контролем и направлять в правоохранительные органы для принятия соответствующих мер выявленные сведения или документы, связанные с проведением религиозной пропаганды иностранцами и лицами без гражданства, посягательством на права по отправлению религиозных культов;

- давать указания, советы и пояснения инструкционного и методического характера по вопросам, касающимся полномочий;

- регистрировать заявления и другую информацию, обеспечивать их рассмотрение в установленном законом порядке;

- осуществлять другие права, установленные законодательством.